新疆天文台是中国综合性天文台之一，是中国西部地区唯一的天文研究机构。新疆天文台现有射电天文、光学天文以及计算机技术三个专业研究室，同时设有中国科学院射电天文重点实验室（分部）、新疆射电天体物理重点实验室、新疆微波技术重点实验室、科技部射电天文与技术国际联合研究中心、中国—中亚天文学史联合研究中心、新疆大学—国家天文台联合天体物理中心等机构。研究方向涵盖了脉冲星辐射特性及引力波探测、恒星形成与演化、星系宇宙学、天体化学、高能天体物理、光学时域天文和大视场巡天、太阳物理、空间目标与碎片和天文技术与方法等，同时承担了深空探测、北斗导航、量子通信等国家重大任务。

本部设在乌鲁木齐市，运行有南山、奇台、慕士塔格、喀什四个基地型野外观测站，主力观测设备有南山26米、25米，喀什13米等射电望远镜，南山1米、1.2米等光学望远镜集群，这些设备除了开展天文学基础研究以外，还承担了多项国家重大观测任务，有力支撑了我国天文与空间科学等相关领域的发展。在自治区和中科院的大力支持下，奇台射电望远镜（QTT）于2022年9月启动建设。QTT作为全球顶级的标志性科技装备，建成后将是国内外天文学家开展前沿研究和探索未知领域的观天利器，也将为我国空间战略任务提供强力保障。