深圳综合粒子设施研究院（以下简称“研究院”），是深圳市委市政府贯彻落实“双区驱动”和创新驱动发展国家重大战略、支撑大湾区综合性国家科学中心建设的公益性科研事业单位,于2020年4月获批成立，实行理事会领导下的院长负责制。

研究院紧密围绕高水平建设综合性国家科学中心战略目标，面向国民经济主战场和世界科技前沿，汇聚全球高端创新资源，依托先行示范区政策、产业、资本、市场和技术等优势，承担“世界一流、深圳特色”的标志性、稀缺性、先进性综合粒子设施等重大科研平台的建设运营任务,服务集成电路、生物医药、先进材料和先进制造等大湾区高新技术产业，以及产业核心关键技术发展相关的物理、化学、生物、材料、医学等多学科前沿基础研究。

研究院位于大湾区综合性国家科学中心核心承载区的光明科学城大科学装置集群核心区内，规划总建筑面积超过35万平方米。2020年8月18日，研究院首栋建筑综合楼开工建设。成立一年多来，研究院已汇聚各类人才200余人，预计2022年底将达到500人规模。