厦门市卫生健康委员会是厦门市人民政府工作部门，副厅级，2019年机构改革期间设立。主要职责包括拟订卫生健康政策规划、实施疾病预防控制、推进医药卫生体制改革、组织人口监测与老龄健康服务，牵头野生中药材资源保护及会同相关部门开展保护工作。下设传染病防控处、体制改革处等18个内设机构。该委员会承担市爱国卫生运动委员会、市老龄工作委员会日常工作，2020年11月获评福建省抗击新冠肺炎疫情先进集体。机构改革中重点推动健康厦门建设，建立覆盖闽西南2400万人口的区域性医疗中心，推进“三师共管”分级诊疗模式，建成16家专病防治中心。实施智慧健康平台整合72项便民服务，开展信用就医模式，在全国率先建立城市级市民健康信息系统。作为国家首批公立医院改革试点城市，完成两轮医疗服务价格动态调整，实现住院+门诊DIP医保支付方式全覆盖。